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3、自然干扰
(1)雨衰。当电波在传输过程中穿过降雨区域时，雨滴会对电波产生吸收和散射造成衰减。衰减的大小与雨滴半径和波长的比值有关，由于C波段波长一般大于雨滴半径而KU波段波长与雨滴大小相近，所以降雨对C波段影响比较小而对KU波段就非常严重，为降低雨衰的影响，在进行卫星通信时尽可能选择使天线处于高仰角的卫星，这样可以减少降雨时电波穿越的雨区距离。但在降雨量大的地区，如广州等，处于高仰角天线的主反射面会因暴雨而形成积水对电波造成很大的吸收损耗，特别是上行，即使C波段也会超出正常的控制范围，解决的办法唯有在天线主反射面底部钻孔加快积水排放。
(2)日凌。每年春分和秋分前后，在卫星地球站所在地的每天中午时分，卫星将处在太阳与地球之间的直线上，这时卫星地球站天线在对准卫星的同时也对准太阳，使太阳产生的强大的电磁波是个巨大的噪声源，对其所接收的卫星信号造成干扰从而使接收链路严重恶化甚至中断，这种现象即称为卫星通信的“日凌现象”。日凌只影响卫星的下行链路，发生时间和接收点的地理位置有关，持续时长和天线的工作频率及口径有关。一般来说，春分时，纬度越高地区日凌开始和结束的日期越早，秋分时相反；若两地经度一样，纬度每相差3度日凌开始和结束的日期就会相差1天；如果两地纬度一样，经度由西向东每增加2度日凌开始和结束的时间就会晚1小时。接收频率高，日凌持续时间短；天线口径大，持续时间短。日凌结束后，通信会自动恢复正常。
(3)电离层闪烁。当电波穿越电离层时，由于电离层结构的不均匀性和随机时变性，造成信号的振幅、相位、到达角等特性短周期变化，形成电离层闪烁。电离层闪烁与工作频率、地理位置和太阳活动情况有关。3GHZ频率以下，电离层闪烁是最为严重的电离层现象。通常，电离层闪烁最严重时发生在春分前后，较为严重在秋分前后。电离层闪烁现象通常持续30分钟到数小时，发生的时间通常在日落后(18:00)至深夜(24:00)结束。虽然电离层闪烁主要发生在3GHZ频率以下，但在4GHZ也有明显的影响。据统计，在4GHZ，电离层闪烁可能造成超过10dB的峰值变化。
(4)卫星蚀。每年的春季和秋季，在每天的特定时间内，卫星将进行入地球的阴影区域，此时卫星见不到太阳光，太阳能电池不能提供电能，卫星只能依靠蓄电池或燃料电池供电，这一阶段称做“星蚀期”。以前卫星蚀对卫星通信的影响是很严重的，但现在卫星供电系统已经有了很大的改进，在卫星蚀期间备用电源足以保持卫星正常工作，因而不会对卫星通信造成影响。
这几种自然干扰是天文自然现象，无法避免，但可以采取一定的措施减少对卫星通信的影响，如改进卫星供电系统就安全克服卫星蚀造成的影响。
4、人为干扰
由于现阶段我们所使用的卫星都是采用透明转发器，对地面传来的信号只是变频转发而不加以任何处理，其主要部件之一是高功放器件，一般为行波管放大器(TWTA)或固态功放(SSPA)。这两种器件最主要的特点是当输入功率小于饱和点时，可以近似地认为工作在线性区，而当输入功率进一步增大超过该电平时，功率放大器就进入饱和区或过饱和区。在过饱和区，不仅输出功率大大降低，而且出现大信号压缩小信号，即所谓的“功率掠夺”现象或“功率占用”，同时由于非线性的因素，还会出现大量寄生互调分量，为避免将卫星上功放推入饱和区或过饱和区，在使用中一般要实行严格的上行功率控制，或在高功放前加限幅器，尽可能使透明转发器可以避免功放工作在过饱和区，但是如果存在恶意的大功率上行干扰，转发器仍然有可能工作在非线性区，依然存在“功率掠夺”现象，致使正常通信业务信号或广播电视信号被压缩。
法轮功等不法分子对广播卫星实施的恶意干扰。利用卫星透明转发器的弱点，法轮功等不法分子干扰我们的正常卫星电视广播，并采用“功率掠夺”的形式进行非法宣传。从已发生的案例来看，这些恶意干扰的技术含量并不高，使用的也不过是卫星通信的常规设备，这暴露了目前我们卫星通信的弱点。对此，我们要采取积极有效措施和相应的技术手段进行反干扰。作为卫星使用者，在现阶段，对这些非法干扰实施反干扰就要以其人之道还治其人之身，一旦发现有恶意干扰就要立即加大上行功率压制非法信号并通知卫星测控中心和相关部门采取措施，共同打击不法分子的嚣张气焰。非全时卫星用??波，占用自己的佥资源，不给不法分子有可乘之机。此外，要认真学习和研究卫星通信新技术，设想未来可能发生的非法干扰方式，结合实际制订应急处理预案，堵截非法信号的传输渠道，保证卫星通信业务正常进行。